本教材分为8章。第1章绪论；第2章环境生物修复基础理论，涵盖了微生物、植物、动物的生物修复原理以及生态修复的基本理论；第3章地表水环境生物修复；第4章为土壤和地下水生物修复，同时涵盖了污染地块和矿山的适用性生物修复技术；第5章固体废物的生物处理技术，侧重于有机固体废物和工业固体废物的生物处理方法；第6章介绍了海绵城市建设中的生物修复技术；第7章农业面源污染的生物修复；第8章对环境生物修复的可处理性、工程设计和评价策略进行了简单介绍。